La criopreservación, un avance para secuenciar células individuales

Los genetistas del Centro Nacional de Análisis Genómico-Centro de Regulación Genómica (CNAG-CRG) han descubierto que la criopreservación del material genético para su posterior secuenciación, aumenta notablemente las posibilidades de llevar a cabo estos análisis. Los investigadores del CNAG-CRG de Barcelona han ampliado la aplicabilidad de la genómica de células individuales combinando la criopreservación de células y tejidos con los flujos de trabajo de este emergente campo de investigación.

El estudio, publicado en ‘Genome Biology’, muestra cómo las células individuales de las muestras criopreservadas tienen perfiles de expresión génica indistinguibles en comparación con células de las muestras procesadas a partir de tejidos frescos.

Este trabajo, según los investigadores, tiene implicaciones importantes en el diseño de estudios de células individuales, ya que las técnicas actuales están limitadas a la disponibilidad de material de partida fresco y excluyen los experimentos en los que no hay un acceso directo a este tipo de muestras.

Según  Holger Heyn, líder del Single Cell Genomics Team del CNAG-CRG, la capacidad de secuenciar y analizar células individuales “está revolucionando nuestro conocimiento sobre tejidos complejos” porque identificar los perfiles moleculares de las células individuales proporciona “una visión sin precedentes sobre la forma en que los organismos, como el cuerpo humano, están construidos y funcionan”.
“La caracterización en profundidad de tejidos complejos no sólo afecta a nuestra comprensión de la vida misma, sino que también agudiza nuestra visión sobre la biología de enfermedades, como el Alzheimer o el cáncer”, ha agregado Heyn.

En esta investigación, han analizado más de 1.000 células individuales de diferentes especies, incluyendo muestras de sangre, colon y tumor, extraídas de material fresco o criopreservado hasta 6 meses y han probado las estrategias de secuenciación de células individuales más populares sin detectar un sesgo sistemático introducido por el procedimiento de criopreservación.

Los investigadores han demostrado que tejidos enteros pueden ser criopreservados, evitando la separación inmediata de células individuales que hasta ahora impedía la recolección de muestras en lugares menos especializados y fuera de las horas de trabajo de las instalaciones. En este sentido, los análisis de células individuales eran difíciles de aplicar en hospitales y clínicas ya que las muestras no podían procesarse inmediatamente.

“Ahora podemos almacenar el material del paciente a lo largo del tratamiento sin la necesidad de procesar la muestra inmediatamente. De hecho, colaboramos con hospitales que comenzaron a almacenar prospectivamente muestras con crioprotectores, proporcionándonos acceso a muestras que antes estaban fuera de nuestro alcance”, ha concluido Heyn.

 

Fuente:Genome Biology

Artículo original: Guillaumet-Adkins et al. Single-cell transcriptome conservation in cryopreserved cells and tissues. Genome Biology (2017) 18:45 DOI 10.1186/s13059-017-1171-9.