Las células B, normales y tumorales, maduras expresan un reordenamiento único del gen de la inmunoglobulina (Ig), característica que sirve como biomarcador para diagnosticar diferentes tipos de leucemias y linfomas. En el caso de las leucemias y linfomas de células B, las mutaciones que llevan asociadas estas inmunoglobulinas permiten distinguir entre diferentes subtipos de tumor y conocer cuál será la evolución clínica de la enfermedad.

Hasta ahora, los reordenamientos y translocaciones de las Ig oncogénicas se evaluaban mediante la secuenciación de Sanger y la hibridación fluorescente in situ. Sin embargo, el análisis completo de las regiones del genoma que contienen la información para generar estas Ig no era posible. Recientemente, investigadores del Hospital Clinic-IDIBAPS han desarrollado y validado una nueva herramienta bioinformática para explorar una región compleja del genoma, esencial para el crecimiento tumoral y que además ayuda al diagnóstico de los diferentes tipos de leucemias y linfomas.

IgCaller es un algoritmo diseñado para caracterizar completamente los reordenamientos de los genes Ig y las translocaciones oncogénicas a partir de datos WGS (Whole Genome Sequencing).

Esta herramienta, aplicada a las secuencias de 400 casos de leucemia linfática crónica y otros linfomas, ha permitido descubrir alteraciones genéticas que hasta ahora no se habían detectado mediante las técnicas habituales y que, además, hacen que los tumores sean más agresivos. También, se han detectado alteraciones que activan oncogenes, es decir, genes que favorecen el desarrollo de los tumores, que no se habían encontrado en los estudios previos de las mismas secuencias.

En definitiva, esta nueva herramienta podría acelerar la incorporación de los estudios de genoma completo en la práctica clínica habitual para hacer un diagnóstico más preciso de la enfermedad y su evolución.

Fuente: EFE

Artículo original: Nadeu, F., Mas-de-les-Valls, R., Navarro, A. et al. IgCaller for reconstructing immunoglobulin gene rearrangements and oncogenic translocations from whole-genome sequencing in lymphoid neoplasms. Nat Commun 11, 3390 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17095-7